Mỗi kháng sinh đều bao gồm ưu điểm và nhược điểm nhất định. Khi kết hợp kháng sinh trong điều trị thì những tác dụng phụ này có thể cũng cộng lại hoặc tăng lên.Việc sử dụng thuốc sai quy định dẫn đến nguy cơ gây nghiện và tác động xấu đến tâm lý và thể chất.